V daném rozsudku se jednalo o doměření DPH v souvislosti s podvodným řetězcem obchodování s pistáciemi, přičemž se měl daňový subjekt nedostatečně zajistit proti účasti v tomto řetězci. V daňovém řízení panoval spor kolem dodržení tříleté lhůty pro stanovení daně. Daňový subjekt trval na tom, že kontrola byla zahájena e-mailovou komunikací, ve které si správce daně vyžádal některé podklady a avizoval následnou kontrolu. Správce daně s tím nesouhlasil a bránil se, že kontrola započala až v okamžiku jejího „oficiálního“ zahájení.
Případ se dostal ke krajskému soudu, který rozhodl ve prospěch daňového poplatníka, tj. že lhůta pro stanovení daně započala již zasláním e-mailu a byla tedy překročena. Správce daně se závěrem soudu nesouhlasil a obrátil se na Nejvyšší správní soud. V projednávaném případě se tak klíčovým prvkem stala otázka, zda e-mail, který správce daně odeslal daňovému subjektu, měl účinky pro zahájení daňové kontroly. KS dospěl k závěru, že správce daně měl dostatek informací pro záměr kontrolovat transakci týkající se obchodování společnosti a tento záměr byl dostatečně prokázán již v zaslaném e-mailu. NSS nicméně se závěrem krajského soudu nesouhlasil s tím, že e-mail správce daně nevedl k materiálnímu zahájení daňové kontroly. Touto kontrolou v materiálním smyslu dle NSS není jakýkoliv sběr informací. Pokud správce daně jenom tzv. mapuje terén – vyhledává a opatřuje předběžné podkladové informace, které ale hodnotí jen vzhledem ke svému dalším potupu, a nikoliv ve vztahu ke konkrétní daňové povinnosti – provádí podle NSS vyhledávací činnost, ne „skrytou“ daňovou kontrolu. Rozlišit vyhledávací činnost a „skrytou“ daňovou kontrolu lze jen na základě celkového posouzení konkrétních úkonů.
V daném případě za materiální zahájení daňové kontroly nebylo možné označit samotný e-mail, ve kterém správce daně připomněl domluvený termín osobního jednání o zahájení daňové kontroly a současně sdělil rozsah požadovaných podkladů. Zásadním přitom dle NSS bylo i to, že na svůj e-mail správce daně ani neočekával odpověď a nevyzýval daňový subjekt k e-mailové komunikaci. Naopak je z e-mailu zřejmé, že jeho účelem vůbec nebylo přímo zahájit kontrolu, ale připomenout, kdy bude kontrola zahájena.
